Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA11P31270 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA11P31270 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms