Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDI1P31150 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDI1P31150 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDI1P31150 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDI1P31150 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDI1P31150 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDI1P31150 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDI1P31150 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDI1P31150 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDI1P31150 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDI1P31150 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDI1P31150 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDI1P31150 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDI1P31150 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDI1P31150 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDI1P31150 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDI1P31150 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDI1P31150 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDI1P31150 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms