Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMPK1P30085 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CMPK1P30085 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms