Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMBRP28336 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMBRP28336 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NMBRP28336 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NMBRP28336 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMBRP28336 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMBRP28336 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMBRP28336 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMBRP28336 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMBRP28336 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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