Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HTR2AP28223 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms