Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB4P28070 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB4P28070 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms