Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK3P27448 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK3P27448 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARK3P27448 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK3P27448 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK3P27448 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK3P27448 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK3P27448 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK3P27448 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARK3P27448 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARK3P27448 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARK3P27448 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARK3P27448 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK3P27448 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK3P27448 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK3P27448 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARK3P27448 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARK3P27448 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms