Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms