Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRBP23467 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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