Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX1P22670 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX1P22670 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX1P22670 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFX1P22670 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms