Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EFNA1P20827 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EFNA1P20827 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms