Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMNB1P20700 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms