Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PVALBP20472 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PVALBP20472 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PVALBP20472 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PVALBP20472 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PVALBP20472 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PVALBP20472 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PVALBP20472 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PVALBP20472 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PVALBP20472 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms