Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD33P20138 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD33P20138 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CD33P20138 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD33P20138 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD33P20138 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms