Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRMP19623 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRMP19623 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRMP19623 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRMP19623 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRMP19623 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRMP19623 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms