Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRAP18433 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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