Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FLT1P17948 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FLT1P17948 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLT1P17948 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLT1P17948 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLT1P17948 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT1P17948 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT1P17948 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT1P17948 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT1P17948 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT1P17948 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLT1P17948 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms