Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB1P16220 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB1P16220 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB1P16220 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CREB1P16220 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CREB1P16220 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CREB1P16220 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREB1P16220 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREB1P16220 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREB1P16220 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREB1P16220 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREB1P16220 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREB1P16220 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms