Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB4P16144 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGB4P16144 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms