Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD44P16070 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD44P16070 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD44P16070 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD44P16070 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD44P16070 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms