Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME1P15531 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME1P15531 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME1P15531 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME1P15531 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NME1P15531 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms