Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYL1P12980 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYL1P12980 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LYL1P12980 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LYL1P12980 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LYL1P12980 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LYL1P12980 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LYL1P12980 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYL1P12980 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYL1P12980 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms