Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms