Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ESRRAP11474 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ESRRAP11474 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms