Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD28P10747 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD28P10747 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD28P10747 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD28P10747 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD28P10747 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD28P10747 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms