Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBP3P10745 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBP3P10745 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBP3P10745 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBP3P10745 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RBP3P10745 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBP3P10745 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBP3P10745 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBP3P10745 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RBP3P10745 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBP3P10745 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBP3P10745 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP3P10745 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP3P10745 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms