Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA6AP0CW24 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms