Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM228BP0C875 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms