Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC172P0C7W6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC172P0C7W6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms