Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UQCRFS1P1P0C7P4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UQCRFS1P1P0C7P4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms