Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L8P0C7I0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L8P0C7I0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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