Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCTP09848 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCTP09848 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCTP09848 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LCTP09848 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LCTP09848 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCTP09848 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCTP09848 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCTP09848 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCTP09848 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCTP09848 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms