Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM2P07951 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM2P07951 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM2P07951 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM2P07951 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM2P07951 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPM2P07951 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms