Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHBP07195 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDHBP07195 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDHBP07195 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDHBP07195 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDHBP07195 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHBP07195 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHBP07195 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHBP07195 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHBP07195 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHBP07195 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHBP07195 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDHBP07195 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms