Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DOAP06340 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DOAP06340 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms