Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBB4AP04350 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4AP04350 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms