Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms