Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTAP01374 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTAP01374 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTAP01374 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LTAP01374 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LTAP01374 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LTAP01374 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LTAP01374 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTAP01374 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTAP01374 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTAP01374 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTAP01374 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTAP01374 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LTAP01374 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LTAP01374 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LTAP01374 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTAP01374 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LTAP01374 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LTAP01374 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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