Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CBX7O95931 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CBX7O95931 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CBX7O95931 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CBX7O95931 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CBX7O95931 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms