Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC24BO95487 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms