Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WISP3O95389 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WISP3O95389 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
WISP3O95389 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
WISP3O95389 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
WISP3O95389 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
WISP3O95389 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WISP3O95389 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WISP3O95389 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
WISP3O95389 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WISP3O95389 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WISP3O95389 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WISP3O95389 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
WISP3O95389 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms