Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RHOBTB3O94955 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOBTB3O94955 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.3 ms