Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FLOT1O75955 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FLOT1O75955 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms