Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms