Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPHP4O75161 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPHP4O75161 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms