Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG13O75143 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG13O75143 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG13O75143 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG13O75143 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG13O75143 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG13O75143 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG13O75143 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG13O75143 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG13O75143 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG13O75143 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG13O75143 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms