Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IGSF3O75054 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF3O75054 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms