Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPLO60437 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPLO60437 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPLO60437 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPLO60437 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPLO60437 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPLO60437 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPLO60437 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PPLO60437 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PPLO60437 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PPLO60437 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PPLO60437 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PPLO60437 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PPLO60437 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PPLO60437 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PPLO60437 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PPLO60437 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms