Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDIL3O43854 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms