Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTN4O43707 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTN4O43707 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms